19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1788 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1788  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  343  5e-94  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.190801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0576  hypothetical protein  66.67 
 
 
178 aa  221  3e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06081  metal-binding protein  48.3 
 
 
176 aa  184  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4712  hypothetical protein  41.26 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0945852  normal  0.92586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0963  protein of unknown function DUF177  39.87 
 
 
167 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.132362 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5263  protein of unknown function DUF177  39.88 
 
 
167 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23091  normal  0.0658863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3437  hypothetical protein  39.86 
 
 
169 aa  106  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1619  metal-binding protein  43.51 
 
 
168 aa  103  8e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.056507 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0689  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.853338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0364  protein of unknown function DUF177  35.76 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0371  protein of unknown function DUF177  35.76 
 
 
167 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.223895  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3814  protein of unknown function DUF177  21.6 
 
 
177 aa  50.4  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.234061  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0939  protein of unknown function DUF177  29.94 
 
 
179 aa  44.7  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000128856  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0826  protein of unknown function DUF177  29.03 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3825  protein of unknown function DUF177  24.32 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000165612  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0941  hypothetical protein  29.45 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248202  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1730  hypothetical protein  22.73 
 
 
161 aa  42  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000131873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1596  hypothetical protein  25.36 
 
 
179 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.3780500000000002e-18  normal  0.312319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1433  hypothetical protein  26.9 
 
 
185 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000012888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>