23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1528 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  415  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.862342  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  80.18 
 
 		 222 aa  294  9e-79  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  69.82 
 
 		 278 aa  281  8.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  59.46 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  58.11 
 
 		 222 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  59.09 
 
 		 221 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  48.15 
 
 		 223 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  47.73 
 
 		 223 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  47.69 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  46.82 
 
 		 222 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  31.96 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  29.49 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  29.3 
 
 		 292 aa  54.7  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  34.83 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  27.68 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  32.62 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0462  hypothetical protein  32.12 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  33.72 
 
 		 997 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  33.72 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  29.71 
 
 		 309 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0489  hypothetical protein  31.88 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  27.87 
 
 		 231 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  31.03 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>