58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1190 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1190  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  490  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.402529  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1287  hypothetical protein  68.75 
 
 
248 aa  310  1e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07821  hypothetical protein  58.16 
 
 
263 aa  264  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00598038 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14261  hypothetical protein  65.28 
 
 
250 aa  261  6e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07261  hypothetical protein  53.62 
 
 
247 aa  259  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.124635  normal  0.0102759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0101  hypothetical protein  53.62 
 
 
247 aa  258  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07221  hypothetical protein  51.84 
 
 
247 aa  245  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.341372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0669  hypothetical protein  51.23 
 
 
245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0343323  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07241  hypothetical protein  51.53 
 
 
220 aa  226  4e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.499188  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07421  hypothetical protein  48.86 
 
 
215 aa  206  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10054  predicted protein  46.67 
 
 
259 aa  204  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0257  hypothetical protein  48.56 
 
 
249 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1453  hypothetical protein  45.15 
 
 
252 aa  190  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2637  protein of unknown function DUF92 transmembrane  44.03 
 
 
248 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4223  hypothetical protein  45.75 
 
 
265 aa  186  5e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.381218  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3466  protein of unknown function DUF92 transmembrane  44.44 
 
 
248 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.871121  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4898  protein of unknown function DUF92 transmembrane  42.21 
 
 
250 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5222  protein of unknown function DUF92 transmembrane  43.98 
 
 
262 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3558  hypothetical protein  43.1 
 
 
261 aa  166  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.523152  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_5597  predicted protein  42.98 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3253  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.64 
 
 
440 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0532  hypothetical protein  32.27 
 
 
401 aa  92.4  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.461547 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0626  hypothetical protein  28.44 
 
 
470 aa  89.4  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.135738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3203  hypothetical protein  42.06 
 
 
236 aa  89  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3310  integral membrane protein  29.58 
 
 
451 aa  87.4  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0165855 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0072  hypothetical protein  33.68 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.813723  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2065  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.68 
 
 
421 aa  84  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.725171  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1227  protein of unknown function DUF92 transmembrane  34.47 
 
 
447 aa  83.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1722  hypothetical protein  30.3 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1500  hypothetical protein  30.65 
 
 
391 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2185  protein of unknown function DUF92 transmembrane  32.82 
 
 
430 aa  78.6  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0972552  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1546  protein of unknown function DUF92 transmembrane  33.51 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0192  protein of unknown function DUF92 transmembrane  31.02 
 
 
447 aa  75.5  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23959  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1343  hypothetical protein  27.51 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1927  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.8 
 
 
277 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000291197  hitchhiker  0.00000025153 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1341  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.328913  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0619  hypothetical protein  30.22 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.675202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1334  hypothetical protein  31.87 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.35069  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1824  hypothetical protein  28.2 
 
 
306 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4686  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.34 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.347886  hitchhiker  0.00149147 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0829  hypothetical protein  32.88 
 
 
273 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1573  hypothetical protein  29.09 
 
 
399 aa  64.3  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0610  membrane protein  26.76 
 
 
526 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2743  hypothetical protein  28.83 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2624  hypothetical protein  30.14 
 
 
401 aa  59.7  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0743  protein of unknown function DUF92 transmembrane  24.63 
 
 
525 aa  58.9  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0893181  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2165  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25.84 
 
 
526 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.937448  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  23.15 
 
 
509 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2383  protein of unknown function DUF92 transmembrane  29.68 
 
 
259 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0855  hypothetical protein  25 
 
 
526 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08260  conserved hypothetical protein TIGR00297  25.74 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2608  hypothetical protein  35.96 
 
 
252 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1613  hypothetical protein  26.39 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0746  protein of unknown function DUF92 transmembrane  25 
 
 
521 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.213381 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1205  hypothetical protein  29.12 
 
 
245 aa  50.4  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4884  hypothetical protein  29.13 
 
 
273 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2266  protein of unknown function DUF92 transmembrane  26.46 
 
 
516 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0189  protein of unknown function DUF92 transmembrane  35.4 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>