50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0888 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0888  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  854    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0975  hypothetical protein  71.6 
 
 
420 aa  577  1.0000000000000001e-163  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18071  glutathione S-transferase  57.77 
 
 
417 aa  487  1e-136  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0908207 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05701  glutathione S-transferase  52.97 
 
 
412 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.830033  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2181  glutathione S-transferase  54.89 
 
 
401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.682429  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0002  fused glutaredoxin-like domain/phycoerythrin related domain-containing protein  52.35 
 
 
413 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2133  putative glutathione S-transferase  54.39 
 
 
401 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06211  glutathione S-transferase  52.35 
 
 
413 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.385137  normal  0.975907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4049  Glutathione S-transferase domain protein  54.14 
 
 
398 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.988877 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0771  hypothetical protein  56.06 
 
 
404 aa  444  1e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.383596  normal  0.439513 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05921  glutathione S-transferase  46.04 
 
 
409 aa  410  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06301  glutathione S-transferase  46.65 
 
 
412 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0566  glutathione S-transferase  45.68 
 
 
408 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.470437  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06221  glutathione S-transferase  45.3 
 
 
411 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.2377  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40218  predicted protein  36.83 
 
 
402 aa  226  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4835  predicted protein  36.81 
 
 
350 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.037505  normal  0.0422052 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46880  predicted protein  33.89 
 
 
576 aa  202  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.68572  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35579  predicted protein  34.98 
 
 
511 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5006  glutathione S-transferase-like protein  28.36 
 
 
407 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0061879  normal  0.748916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0356  glutaredoxin  27.6 
 
 
427 aa  103  8e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.655994  normal  0.103709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00524  glutathione S-transferase  26.63 
 
 
234 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  21.83 
 
 
237 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10695  glutathione transferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11770)  25.11 
 
 
289 aa  52.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2245  glutathione S-transferase-like  22.62 
 
 
220 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.556118  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02380  expressed protein  26.32 
 
 
262 aa  52  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  26 
 
 
222 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4176  glutathione S-transferase-like  25.62 
 
 
225 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  22.93 
 
 
236 aa  50.4  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0910  Glutathione S-transferase domain  31.51 
 
 
203 aa  50.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09299  glutathione transferase (Eurofung)  30.84 
 
 
237 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.018125  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2451  Glutathione S-transferase domain protein  27.83 
 
 
224 aa  48.5  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00188128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3433  glutathione S-transferase family protein  29.11 
 
 
214 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000284771 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1057  Glutathione S-transferase domain protein  32.88 
 
 
203 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0628244  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5690  glutathione S-transferase-like protein  22.68 
 
 
227 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3329  Glutathione S-transferase domain  28.78 
 
 
235 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.574785 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04905  Putative uncharacterized proteinTheta class glutathione S-transferase ;(EC 2.5.1.18) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJZ8]  38.55 
 
 
302 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0318236  normal  0.302303 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3453  Glutathione S-transferase domain  28.78 
 
 
235 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1180  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.2 
 
 
207 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.610567  normal  0.0747789 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.06 
 
 
229 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2666  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.33 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0074512  normal  0.597042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0502  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.66 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4686  glutathione S-transferase domain-containing protein  22.11 
 
 
205 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1256  hypothetical protein  30.88 
 
 
233 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3325  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.03 
 
 
205 aa  44.3  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5040  glutathione S-transferase domain-containing protein  20.1 
 
 
221 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.367084 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0346  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.12 
 
 
231 aa  43.5  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2420  glutathione S-transferase-like  32.35 
 
 
217 aa  43.5  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.608511  normal  0.0917886 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1347  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.4 
 
 
205 aa  43.1  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0485026 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2784  Glutathione S-transferase domain protein  25.58 
 
 
208 aa  43.1  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000939416  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1254  glutathione S-transferase-like  22.63 
 
 
229 aa  43.1  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0201238  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>