20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1689 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1689  hypothetical protein  100 
 
 		 388 aa  764    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1428  hypothetical protein  54.74 
 
 		 381 aa  393  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.521801  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10711  hypothetical protein  28.87 
 
 		 388 aa  189  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.319358  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0996  hypothetical protein  29.05 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10691  hypothetical protein  26.96 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.97155  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  30.45 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1399  hypothetical protein  28.95 
 
 		 369 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.128745  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10711  hypothetical protein  26.96 
 
 		 388 aa  162  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 347 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  34.21 
 
 		 361 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  25.83 
 
 		 354 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.78 
 
 		 324 aa  52.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  42.86 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  29.81 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  29.81 
 
 		 327 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2155  glycine/D-amino acid oxidase (deaminating)-like protein  24.45 
 
 		 604 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.195632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.75 
 
 		 346 aa  43.9  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  25.42 
 
 		 466 aa  43.5  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>