27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0871 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0871  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  414  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.390024  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1528  hypothetical protein  80.18 
 
 
222 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.862342  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19751  hypothetical protein  69.47 
 
 
278 aa  288  3e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0679603 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1750  hydrogenase accessory protein or high-affinity nickel-transport protein homolog, membrane protein  58.11 
 
 
222 aa  244  9e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.1232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04681  hypothetical protein  56.76 
 
 
222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.668858  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13431  hypothetical protein  59.45 
 
 
221 aa  235  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1392  hypothetical protein  46.33 
 
 
223 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14951  hypothetical protein  46.73 
 
 
223 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.324822  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14811  hypothetical protein  46.26 
 
 
223 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.716818  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14571  hypothetical protein  46.4 
 
 
222 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3913  high-affinity nickel-transporter  27.78 
 
 
238 aa  68.2  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47092  predicted protein  26.57 
 
 
292 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1851  high-affinity nickel-transporter  29.06 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0801332  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0462  hypothetical protein  32.93 
 
 
199 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27426  P-ATPase family transporter: cadmium/zinc ion; heavy metal translocating P-type ATPase family-like protein  34.88 
 
 
997 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.040121  normal  0.339459 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43009  NiCoT family transporter: nickel ion; high affinity nickel transporter-like protein  34.88 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0978739  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1153  high-affinity nickel-transporter  30.5 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.608233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4480  hypothetical protein  27.07 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.17724  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3876  high-affinity nickel-transporter  27.01 
 
 
232 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0489  hypothetical protein  31.88 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48510  predicted protein  27.93 
 
 
309 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2044  hypothetical protein  27.17 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.150592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1254  urease accessory protein  23.86 
 
 
196 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.735612  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3212  high-affinity nickel-transporter  29.78 
 
 
239 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_93398  predicted protein  28.57 
 
 
329 aa  42.7  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3875  putative urease accessory protein  27.98 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4511  hypothetical protein  27.74 
 
 
244 aa  42  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.623088 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>