18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1998 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1998  hypothetical protein  100 
 
 		 64 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0017  hypothetical protein  73.33 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.45132  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1544  hypothetical protein  72.58 
 
 		 106 aa  95.1  3e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000142807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3721  hypothetical protein  55.17 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1863  hypothetical protein  57.63 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7219  hypothetical protein  58.62 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.54392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4088  hypothetical protein  47.62 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0409  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.391541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0405  hypothetical protein  43.75 
 
 		 117 aa  56.6  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0536  protein of unknown function DUF898 transmembrane  52.08 
 
 		 360 aa  47  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.229414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0325  hypothetical protein  52.17 
 
 		 372 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.714394  normal  0.0811524 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0643  hypothetical protein  41.67 
 
 		 358 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0580  protein of unknown function DUF898 transmembrane  50 
 
 		 357 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.395868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2916  hypothetical protein  36.36 
 
 		 401 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.646021  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0387  protein of unknown function DUF898 transmembrane  48.89 
 
 		 360 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0342219  normal  0.0662296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0097  hypothetical protein  44.44 
 
 		 421 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0128644  normal  0.289564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2800  hypothetical protein  48.89 
 
 		 356 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6657  hypothetical protein  33.33 
 
 		 377 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.255906 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>