22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4881 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4881  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  100 
 
 		 111 aa  223  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.968841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2467  hypothetical protein  46.85 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0625027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3647  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  46.85 
 
 		 113 aa  114  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3007  hypothetical protein  54.08 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2934  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  42.06 
 
 		 112 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1647  hypothetical protein  54 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3814  hypothetical protein  34.02 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0232348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.96 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.136342  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2408  hypothetical protein  37.11 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0047067  hitchhiker  0.00000146702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2867  hypothetical protein  34.82 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2484  hypothetical protein  38.14 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0333285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1516  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  31.18 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0181128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2566  hypothetical protein  31.82 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.99038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1820  hypothetical protein  36.56 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0593  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  38.37 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.879412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1846  hypothetical protein  32.69 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1228  hypothetical protein  34.94 
 
 		 114 aa  46.2  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2653  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  35.11 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0705201 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2131  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  28.45 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1083  hypothetical protein  34.86 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.16763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2298  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  32.22 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3631  transcriptional modulator of MazE/toxin, MazF  27.19 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>