More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4712 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4712  glutaredoxin-like protein  100 
 
 		 109 aa  225  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.729225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2519  glutaredoxin-like protein  72.48 
 
 		 109 aa  171  2.9999999999999996e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.134397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0357  glutaredoxin-like protein  79.61 
 
 		 110 aa  163  9e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.66028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2667  glutaredoxin-like protein  64.08 
 
 		 115 aa  150  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.144494  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2149  glutaredoxin-like protein  64.65 
 
 		 111 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.907449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0773  glutaredoxin-like protein  66.34 
 
 		 109 aa  140  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.045295 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0123  glutaredoxin-like protein  63 
 
 		 110 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.826994 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2584  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.442279  normal  0.361888 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1939  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 111 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0007  glutaredoxin-like protein  58.65 
 
 		 112 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1936  glutaredoxin-related protein  60.19 
 
 		 111 aa  137  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1312  glutaredoxin-like protein  59.22 
 
 		 112 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3524  glutaredoxin-like protein  66.67 
 
 		 103 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00765276  normal  0.116899 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4088  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 128 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1641  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 113 aa  136  7.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0011  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 		 112 aa  136  7.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5478  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 107 aa  135  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1661  glutaredoxin-like protein  59.8 
 
 		 107 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.147009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0974  glutaredoxin-related protein  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.104778  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1945  glutaredoxin-related protein  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.980346  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0502  glutaredoxin-related protein  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3605  glutaredoxin-like protein  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1556  glutaredoxin-like protein  63.37 
 
 		 105 aa  135  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461361 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3616  putative glutaredoxin  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0848  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 109 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.609526  normal  0.565462 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3592  putative glutaredoxin  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.703507  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0678  glutaredoxin-related protein  64.65 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1710  putative monothiol glutaredoxin  57.14 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0700819 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2391  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2723  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4208  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 110 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3704  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.473777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1116  glutaredoxin-like protein  57.69 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0438  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.315589 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0412  glutaredoxin-like protein  63.64 
 
 		 103 aa  134  4e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.738354  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1599  glutaredoxin-like protein  59.05 
 
 		 123 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.283027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0434  glutaredoxin-like protein  65.66 
 
 		 103 aa  134  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1021  glutaredoxin-like protein  57.55 
 
 		 110 aa  134  6.0000000000000005e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681267  normal  0.445361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1426  glutaredoxin-like protein  63.46 
 
 		 109 aa  133  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1273  glutaredoxin-like protein  58.59 
 
 		 111 aa  133  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.909876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2890  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 103 aa  133  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.441106 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2171  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.95609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0849  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.539719  normal  0.527344 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0577  glutaredoxin-like protein  68.04 
 
 		 103 aa  133  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.220445 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0778  glutaredoxin-like protein  64.36 
 
 		 109 aa  133  9e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.228725  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1508  glutaredoxin-like protein  60.61 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0014  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.110732  normal  0.900956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0012  glutaredoxin-like protein  57.28 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10761  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 		 107 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.431003 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2932  glutaredoxin-related protein  63.64 
 
 		 102 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5393  putative glutaredoxin family protein  57.84 
 
 		 112 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0013  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 		 111 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9035  predicted protein  57.43 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958741  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4728  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0939613  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3595  glutaredoxin-like protein  62.63 
 
 		 103 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.826772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0595  glutaredoxin-like protein  61.39 
 
 		 109 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0120135  hitchhiker  6.40079e-17 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5883  putative glutaredoxin family protein  62.63 
 
 		 109 aa  131  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0738843  normal  0.762824 
 
 
-
 
NC_004310  BR0835  glutaredoxin-related protein  60.61 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0480  glutaredoxin-like protein  61.62 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.505328 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0187  glutaredoxin-like protein  50.46 
 
 		 111 aa  131  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.381703  normal  0.468757 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0827  glutaredoxin-related protein  60.61 
 
 		 130 aa  131  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2597  glutaredoxin-like protein  61.62 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583628  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1124  glutaredoxin-like protein  56.31 
 
 		 112 aa  131  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0508  glutaredoxin-like protein  61.62 
 
 		 103 aa  131  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10469  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3466  glutaredoxin-like protein  60.4 
 
 		 113 aa  130  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.147483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0705  glutaredoxin-like protein  57.84 
 
 		 109 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1796  glutaredoxin-like protein  57.14 
 
 		 108 aa  130  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1760  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.608629  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12171  glutaredoxin-like protein  58.76 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.537864  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2734  glutaredoxin-like protein  53.92 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.546465  hitchhiker  0.0000029189 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09521  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.221598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3377  glutaredoxin-like protein  53.92 
 
 		 107 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0520  hypothetical protein  63.37 
 
 		 110 aa  130  6e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1276  glutaredoxin-like protein  61.39 
 
 		 108 aa  130  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4396  glutaredoxin-like protein  55.88 
 
 		 114 aa  130  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.308725 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0591  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 107 aa  130  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_8492  predicted protein  59 
 
 		 123 aa  130  6.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00589447  normal  0.207924 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3204  glutaredoxin-like protein  62.38 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1392  glutaredoxin-like protein  56.19 
 
 		 120 aa  129  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.394027  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3047  glutaredoxin-like protein  64.65 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.994053  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2953  glutaredoxin-related protein  54.63 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1145  glutaredoxin-like protein  53.92 
 
 		 108 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1598  glutaredoxin-like protein  54.63 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0834574 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1556  glutaredoxin-like protein  61.86 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1496  glutaredoxin-like protein  61.86 
 
 		 308 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.353854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3886  glutaredoxin-like protein  60.82 
 
 		 308 aa  128  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12181  glutaredoxin-like protein  62.22 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2784  glutaredoxin-like protein  54.64 
 
 		 107 aa  127  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0701  glutaredoxin-like protein  50 
 
 		 110 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.244741  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0892  glutaredoxin-like protein  53.7 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.137957 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0302  glutaredoxin-related protein  49.54 
 
 		 110 aa  127  6e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.354475  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12021  glutaredoxin-like protein  53.92 
 
 		 107 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0639  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1418  glutaredoxin-like protein  54.9 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.448786  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14711  glutaredoxin-like protein  50.98 
 
 		 107 aa  126  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.211551  normal  0.903864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0245  glutaredoxin-like protein  57.43 
 
 		 105 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.254771  normal  0.100624 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1186  glutaredoxin-like protein  60.2 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.242969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2078  glutaredoxin-related protein  59.18 
 
 		 110 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2904  hypothetical protein  64.21 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3683  glutaredoxin-like protein  58.1 
 
 		 106 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>