More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3912 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3912  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  100 
 
 
111 aa  218  9.999999999999999e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2181  HesB/YadR/YfhF  63.55 
 
 
122 aa  138  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0155  HesB/YadR/YfhF  71.91 
 
 
131 aa  137  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3125  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  51.43 
 
 
110 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185787  normal  0.24612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2468  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.11 
 
 
108 aa  114  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.698044  normal  0.0161049 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0349  HesB/YadR/YfhF  49.54 
 
 
113 aa  114  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1756  HesB/YadR/YfhF  49.06 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0629  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0608  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581475  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0748  HesB/YadR/YfhF family protein  48.11 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00160104  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2171  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.17 
 
 
108 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.367568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1809  HesB/YadR/YfhF  48.11 
 
 
110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.918126 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4426  hypothetical protein  49.51 
 
 
113 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.939817  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3701  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
130 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1012  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
115 aa  111  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0494  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
124 aa  110  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.188955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0605  HesB/YadR/YfhF family protein  48.11 
 
 
116 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4568  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
116 aa  110  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.420029  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0433  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
132 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.282495  normal  0.240783 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0466  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
132 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.147286  hitchhiker  0.00198975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0463  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
132 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0092949  normal  0.21785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0385  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.3 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0370  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  45.3 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.828818  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46030  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.96 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4770  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.06 
 
 
132 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00616694  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1830  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
128 aa  110  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0806  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.92 
 
 
116 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08510  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.92 
 
 
116 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.64455  hitchhiker  0.000000019455 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02949  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  54.46 
 
 
102 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2678  hypothetical protein  43.52 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0428066  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1587  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.49 
 
 
128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000319223  normal  0.730386 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3457  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.549303  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2506  HesB/YadR/YfhF  45.37 
 
 
109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3328  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2797  HesB/YadR/YfhF  48.57 
 
 
110 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0272946  normal  0.118231 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0992  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4049  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50 
 
 
121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3101  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.77 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4676  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  50.48 
 
 
121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2642  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.52 
 
 
121 aa  109  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0615003  normal  0.651283 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1883  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.55 
 
 
124 aa  108  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0104444  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1763  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
128 aa  108  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.910662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0696  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
114 aa  108  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3930  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
116 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0777842  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5912  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.04 
 
 
124 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.106934  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0456  HesB-like protein  46.96 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00139708  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03416  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
118 aa  108  4.0000000000000004e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1038  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
114 aa  107  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002592  probable iron binding protein from the HesB_IscA_SufA family  51.89 
 
 
113 aa  107  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000217279  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0725  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.52 
 
 
120 aa  107  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0060  HesB/YadR/YfhF  48.54 
 
 
117 aa  107  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00961876  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1442  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
124 aa  107  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0402332  hitchhiker  0.0055287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1176  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  53.77 
 
 
115 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0694  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  49.09 
 
 
110 aa  107  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.134882  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5101  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.11 
 
 
116 aa  107  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105722  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1235  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  107  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.014396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1567  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.4 
 
 
125 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.679568 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00155  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0844393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3446  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0160  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0148  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0168  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4109  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  49.51 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0161  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00154  hypothetical protein  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0585219  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3503  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.911053  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0166  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  107  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2809  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
114 aa  106  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0242  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132384  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0227  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3448  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  48.57 
 
 
121 aa  106  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0379124 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0241  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0225  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0632287  normal  0.831561 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0224  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  52.83 
 
 
114 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0783  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50 
 
 
114 aa  106  1e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0156  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  51.89 
 
 
113 aa  105  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0653  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.57 
 
 
116 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.8310399999999997e-21  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2752  HesB/YadR/YfhF  46.67 
 
 
110 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.271088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01609  HesB protein family  49.06 
 
 
116 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1815  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  44.76 
 
 
116 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.444261  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0435  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.25 
 
 
122 aa  105  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.259298  normal  0.0210981 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2571  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.75 
 
 
113 aa  105  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.37717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2815  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  104  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0995979  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3583  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  45.28 
 
 
108 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2142  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  47.32 
 
 
120 aa  105  3e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.569237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1480  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  41.9 
 
 
110 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.692508  normal  0.631943 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0836  hypothetical protein  50 
 
 
117 aa  104  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0132349  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1123  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  103  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4622  HesB/YadR/YfhF family protein  47.17 
 
 
113 aa  103  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2889  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.113097  hitchhiker  0.000000819699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2971  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  103  7e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.141042  unclonable  0.0000372349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3067  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  48.65 
 
 
116 aa  103  7e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0351916  hitchhiker  0.000000150734 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0867  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  50.94 
 
 
118 aa  103  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0569822  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3767  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
123 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.877653  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2521  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0471  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
122 aa  102  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0242787  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3376  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000296578  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1915  iron-sulfur cluster assembly accessory protein  43.52 
 
 
109 aa  102  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0681  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  46.15 
 
 
123 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0105609  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3412  iron-sulfur cluster insertion protein ErpA  47.12 
 
 
122 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.217175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>