214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0188 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0188  MucR family transcriptional regulator  100 
 
 		 162 aa  326  9e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.17325  normal  0.54796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2834  ROSMUCR transcriptional regulator  47.18 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3060  transcriptional regulator, MucR family  47.18 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2952  transcriptional regulator, MucR family  44.1 
 
 		 160 aa  122  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2474  transcriptional regulator, MucR family  46.27 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1917  MucR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7625  transcriptional regulator, MucR family  43.38 
 
 		 166 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5190  MucR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 308 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.533774 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1153  MucR family transcriptional regulator  42.76 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.877039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2239  MucR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 154 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247755  normal  0.0103363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6739  MucR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.055135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6164  MucR family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2468  transcriptional regulator, MucR family  42.34 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3684  transcriptional regulator, MucR family  40.49 
 
 		 162 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3787  ROSMUCR transcriptional regulator  43.85 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3505  transcriptional regulator, MucR family  41.67 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2999  transcriptional regulator, MucR family  43.85 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5073  transcriptional regulator, MucR family  52.29 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1559  transcriptional regulator, MucR family  44.19 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.192096  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6899  MucR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.106465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8754  transcriptional regulator, MucR family  38.67 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5240  transcriptional regulator, MucR family  42.76 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.672182 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2438  ROSMUCR transcriptional regulator  47.79 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.634995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4375  MucR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1006  MucR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 144 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5627  transcriptional regulator, MucR family  40.91 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.698408  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7194  transcriptional regulator, MucR family  43.26 
 
 		 145 aa  108  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5315  transcriptional regulator, MucR family  42.96 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.160957  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4773  ROSMUCR transcriptional regulator  42.76 
 
 		 175 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.494992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4087  transcriptional regulator, MucR family  49.56 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.242362  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0549  transcriptional regulator, MucR family  43.36 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.973698  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5932  MucR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 145 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6343  transcriptional regulator, MucR family  40 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0871  MucR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 138 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1838  MucR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0743894  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8232  transcriptional regulator, MucR family  46.77 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0643273  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4988  transcriptional regulator, MucR family  43.18 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.103901  normal  0.173335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3346  MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 163 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6541  transcriptional regulator, MucR family  40.43 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7826  transcriptional regulator, MucR family  38.99 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3504  transcriptional regulator, MucR family  42.55 
 
 		 131 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0075  MucR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3902  transcriptional regulator, MucR family  39.86 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5185  MucR family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 185 aa  105  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238338  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0270  transcriptional regulator, MucR family  44.78 
 
 		 153 aa  104  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8753  transcriptional regulator, MucR family  40.97 
 
 		 175 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.286217  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2842  MucR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 139 aa  104  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.840232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3845  transcriptional regulator, MucR family  42.55 
 
 		 135 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581929  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1673  transcriptional regulator, MucR family  37.41 
 
 		 137 aa  104  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233018 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2227  ROSMUCR transcriptional regulator  41.01 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0000658566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3559  transcriptional regulator, MucR family  43.36 
 
 		 144 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4474  ROSMUCR transcriptional regulator  41.67 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4938  transcriptional regulator, MucR family  41.67 
 
 		 176 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.686756  normal  0.493177 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0985  MucR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 145 aa  103  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.933762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5564  MucR family transcriptional regulator  40 
 
 		 156 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2620  transcriptional regulator, MucR family  47.79 
 
 		 140 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.297322  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8109  transcriptional regulator, MucR family  40.67 
 
 		 173 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1808  transcriptional regulator, MucR family  43.26 
 
 		 160 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6743  MucR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.328928  normal  0.300512 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4669  MucR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4852  MucR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6603  MucR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.108608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2484  transcriptional regulator, MucR family  42.86 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.281768  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1341  MucR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3197  transcriptional regulator, MucR family  42.66 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.345502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2384  MucR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0124  transcriptional regulator, MucR family  42.03 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.376819  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2365  transcriptional regulator, MucR family  38.64 
 
 		 176 aa  101  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0068  transcriptional regulator, MucR family  39.39 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2057  transcriptional regulator, MucR family  40.44 
 
 		 138 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2627  MucR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.337964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0536  transcriptional regulator, MucR family  44.2 
 
 		 176 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4944  MucR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 158 aa  100  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5488  MucR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 158 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.622801  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1517  MucR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.400145  normal  0.0460522 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4660  transcriptional regulator, MucR family  43.18 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20016  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7402  transcriptional regulator, MucR family  40.46 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.169134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1357  MucR family transcriptional regulator  39.16 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.067604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1345  transcriptional regulator, MucR family  43.75 
 
 		 166 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000373643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4242  MucR family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.505899  normal  0.307223 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4097  MucR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.812633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4811  transcriptional regulator, MucR family  39.86 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6579  transcriptional regulator, MucR family  43.08 
 
 		 166 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5207  MucR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240071 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1610  transcriptional regulator, MucR family  43.75 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6298  MucR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0539112 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0997  MucR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1889  MucR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1890  MucR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4730  MucR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 145 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3042  MucR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 138 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1029  MucR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 146 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3766  MucR family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3519  MucR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 139 aa  98.6  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  0.722255 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5269  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.898275 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4324  MucR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0666853 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4253  transcriptional regulator, MucR family  40.13 
 
 		 147 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4977  transcriptional regulator, MucR family  38.15 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443589  normal  0.0364251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0503  transcriptional regulator, MucR family  37.68 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0293653 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0608  MucR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 166 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0460505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>