33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_21400 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_21400  ankyrin repeat protein  100 
 
 
320 aa  643    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.667673  normal  0.396106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3898  hypothetical protein  39.12 
 
 
331 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.266705  normal  0.686099 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2852  ankyrin  41.18 
 
 
205 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0765  hypothetical protein  34.35 
 
 
324 aa  50.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1183  ankyrin  42.25 
 
 
157 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0685  Ankyrin  38.27 
 
 
140 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0103  ankyrin  43.28 
 
 
125 aa  49.3  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  36.99 
 
 
329 aa  48.5  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  48.21 
 
 
931 aa  48.1  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3104  ankyrin  48.15 
 
 
574 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.519115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0162  ankyrin  48.28 
 
 
141 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03775  conserved hypothetical protein  37.5 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0173  Ankyrin  45.45 
 
 
149 aa  46.2  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.947078  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0285  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  30.11 
 
 
200 aa  46.2  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0155  Ankyrin  45.45 
 
 
149 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  46.77 
 
 
870 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0324  ankyrin repeat-containing protein  48.28 
 
 
142 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3286  Ankyrin  35.79 
 
 
708 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  36.25 
 
 
790 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09003  conserved hypothetical protein  31.11 
 
 
1387 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  27.45 
 
 
891 aa  45.1  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3277  ankyrin  38.03 
 
 
140 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  27.45 
 
 
483 aa  44.3  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  36.11 
 
 
954 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1729  ankyrin  30.71 
 
 
172 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  36.14 
 
 
474 aa  43.1  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3435  ankyrin repeat-containing protein  46.55 
 
 
141 aa  43.5  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  35 
 
 
1030 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3433  Ankyrin  35.29 
 
 
716 aa  42.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.314955  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0637  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  34.83 
 
 
208 aa  42.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  38.36 
 
 
545 aa  42.4  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05527  ankyrin repeat-containing protein  41.38 
 
 
150 aa  42.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.546638 
 
 
-
 
NC_002978  WD0292  ankyrin repeat-containing prophage LambdaW1  27.84 
 
 
701 aa  42.4  0.01  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>