11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_18270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_18270  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2682  hypothetical protein  30.22 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0583833 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26890  hypothetical protein  32.11 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.66835 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2740  hypothetical protein  34.74 
 
 		 374 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3720  hypothetical protein  29.68 
 
 		 283 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5510  hypothetical protein  30.35 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.242777  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1992  hypothetical protein  30.33 
 
 		 235 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000239593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 246 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  0.906304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1607  hypothetical protein  26.64 
 
 		 247 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0492  hypothetical protein  25.76 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  28.12 
 
 		 464 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>