18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09300 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09300  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  327  3e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.307281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6629  hypothetical protein  41.83 
 
 		 297 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000250395  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0919  hypothetical protein  30.67 
 
 		 200 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1553  hypothetical protein  29.33 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1530  hypothetical protein  29.33 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.849231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2242  hypothetical protein  31.62 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1136  hypothetical protein  30.37 
 
 		 226 aa  44.7  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4598  hypothetical protein  28.29 
 
 		 244 aa  44.3  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2818  hypothetical protein  24.58 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.677475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4088  hypothetical protein  26.72 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.171858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4164  hypothetical protein  26.72 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4318  hypothetical protein  26.72 
 
 		 216 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.282187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12003  MCE associated membrane protein  28.32 
 
 		 191 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0011136  normal  0.99574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4317  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.303802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4163  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.9581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4087  hypothetical protein  31.25 
 
 		 206 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.4084  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0646  hypothetical protein  27.78 
 
 		 221 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2107  hypothetical protein  25.17 
 
 		 225 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.488685  normal  0.536684 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>