18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07420 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  100 
 
 		 234 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  33 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  28.72 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  30.1 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  30.73 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  27.12 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  27.94 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  32.12 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  32.12 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  32.12 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  27.96 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  28.35 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  24.32 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  24.56 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  20.71 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  25.98 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12959  lipoprotein lppX  29.21 
 
 		 233 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0200622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  24.4 
 
 		 262 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>