More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_R0045 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_R0045  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0047  tRNA-Met  92.21 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0224  tRNA-Met  94.12 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000093753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5037  tRNA-Met  94.12 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.794581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0052  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0029  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000365135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4566  tRNA-Met  94.12 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  0.0841904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0062  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5049  tRNA-Met  94.12 
 
 		 79 bp  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000236234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0013  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.105797  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0039  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0081  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000214937  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0057  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000630751  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0046  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000150428  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0131  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.14207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0082  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000739583  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1572  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1607  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.836309 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0753  tRNA-Met  93.85 
 
 		 74 bp  97.6  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0540995  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0036  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465493  normal  0.444935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0005  tRNA-Met  96.49 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0282  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5667  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000879492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0060  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.189075  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5667  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5675  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000376256  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5699  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000350684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5720  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0159176  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0604  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000969852  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0306  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-2  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0182265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-4  tRNA-Met  92.65 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00179817  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-7  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-3  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00436106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.65 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.996221  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Met-6  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00001255  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-2  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0383767  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-3  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000267735  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-5  tRNA-Met  92.65 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000520832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Met-8  tRNA-Met  95 
 
 		 80 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5737  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000112746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4773  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000665438  hitchhiker  6.54659e-16 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0127  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00272429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0057  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0113  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000187631  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0078  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000612862  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0042  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-2  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.527253  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000768608  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-6  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00021362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5710  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0037  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.48693 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0090  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.419074  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0865  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000813952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5678  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.015213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0790  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3991e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5022  tRNA-Met  92.65 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00192595  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0076  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0262196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0073  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0105  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0093247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5807  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00231597  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0058  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.263555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4991  tRNA-Met  92.65 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0056  tRNA-Met  96.43 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0529  tRNA-Met  95 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1797900000000004e-29 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0109  tRNA-Met  92.65 
 
 		 77 bp  95.6  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000630943  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0018  tRNA-Met  96.36 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00237238  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0028  tRNA-Met  94.92 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00000000334964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0021  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.114788  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1598  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000050926  normal  0.567134 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.74 
 
 		 80 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000174152  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Met-3  tRNA-Met  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000104946  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  92.31 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet03  tRNA-Met  90.91 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0036  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-2  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0056  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0069  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00149713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0058  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000407746  normal  0.446811 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0024  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230769 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0058  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.547375 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0022  tRNA-Met  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000159989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0014  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0018085  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0018  tRNA-Met  93.33 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0012  tRNA-Met  97.92 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000000664581  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>