80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0867 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0867  OsmC-like protein  100 
 
 
154 aa  317  3e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1593  OsmC family protein  30.1 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2578  OsmC family protein  29.29 
 
 
142 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  33.68 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5001  OsmC family protein  31.31 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000117697  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2834  OsmC family protein  29.03 
 
 
138 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1013  OsmC family protein  27.59 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2638  hypothetical protein  29.93 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  28.03 
 
 
136 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0674  OsmC family protein  27.21 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.951893  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1486  OsmC-like protein  28 
 
 
147 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000320434  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3731  OsmC family protein  30 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.159888 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1495  OsmC family protein  28.28 
 
 
141 aa  50.8  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  28.68 
 
 
140 aa  50.8  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02740  OsmC family protein  26.15 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0203  OsmC family protein  32.56 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0158527  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1434  OsmC family protein  33.67 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1564  OsmC family protein  23.91 
 
 
146 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  29.55 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2555  OsmC family protein  29.7 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.706281  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0008  OsmC family protein  28 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2780  OsmC family protein  27.07 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971962  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  31.91 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06689  hypothetical protein  25.78 
 
 
136 aa  48.1  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  31.91 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  32.29 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  31.91 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  31.91 
 
 
139 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0008  OsmC family protein  27 
 
 
138 aa  47.8  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  28.93 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2244  OsmC-like protein  25.53 
 
 
135 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.990359  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  23.97 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  25.78 
 
 
132 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  26.09 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  26.09 
 
 
141 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  28.87 
 
 
144 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  25.53 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4022  OsmC-like protein  27.69 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  24.43 
 
 
138 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  27.27 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  26.05 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  28.72 
 
 
135 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  29.03 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2813  OsmC family protein  27.72 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  29.79 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1720  OsmC family protein  28.41 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00202402  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2692  OsmC family protein  25.24 
 
 
161 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0751564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
154 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  23.66 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0153  OsmC family protein  23.91 
 
 
153 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.818803  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  27.66 
 
 
134 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0861  OsmC family protein  27.27 
 
 
142 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458786  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0627  OsmC family protein  27.34 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  26.6 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  28.72 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  24.24 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  24.24 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  24.24 
 
 
140 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  22.14 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
140 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  27.66 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  31.58 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  27.66 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  23.48 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  23.48 
 
 
140 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  24.24 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  23.48 
 
 
140 aa  40.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2833  OsmC family protein  24.75 
 
 
150 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.63516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  24.24 
 
 
140 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>