154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0451 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0451  OsmC/Ohr family protein  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00446662  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0380  OsmC-like protein  72.46 
 
 		 154 aa  218  3e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0303481  normal  0.204016 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0342  OsmC-like protein  68.84 
 
 		 138 aa  203  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18197  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2796  OsmC/Ohr family protein  69.34 
 
 		 149 aa  203  6e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.122145  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1750  OsmC/Ohr family protein  67.15 
 
 		 138 aa  203  7e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.597502  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0953  OsmC-like protein  66.42 
 
 		 139 aa  196  7.999999999999999e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2356  OsmC family protein  64.49 
 
 		 142 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3942  OsmC family protein  64.49 
 
 		 140 aa  186  9e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0408  OsmC-like protein  62.14 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000203576  normal  0.066657 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5110  OsmC-like protein  63.77 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46090  OsmC family protein  62.32 
 
 		 140 aa  184  4e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0648  OsmC-like protein  64.06 
 
 		 142 aa  183  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000386556  normal  0.0907025 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3241  OsmC/Ohr family protein  62.59 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.105127  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2842  OsmC family protein  62.59 
 
 		 141 aa  183  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000324994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0597  OsmC/Ohr family protein  62.32 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08380  hypothetical protein  63.77 
 
 		 140 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000457395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0794  hypothetical protein  63.77 
 
 		 140 aa  183  9e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4576  OsmC-like protein  63.04 
 
 		 140 aa  182  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3355  OsmC family protein  58.7 
 
 		 140 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566205  hitchhiker  0.00000500952 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0425  OsmC family protein  63.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.864591 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2047  OsmC family protein  61.76 
 
 		 138 aa  181  3e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00638742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0756  hypothetical protein  64.03 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.182119 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0458  OsmC family protein  63.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0656635 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0455  OsmC family protein  63.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.386718 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4778  OsmC family protein  63.77 
 
 		 140 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.332624 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0466  OsmC-like protein  61.15 
 
 		 140 aa  180  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000604896  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0605  putative OsmC-like protein  57.97 
 
 		 140 aa  180  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000773894  normal  0.148493 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0525  OsmC family protein  60.74 
 
 		 140 aa  177  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3860  OsmC family protein  61.31 
 
 		 143 aa  177  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598939  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3422  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042421  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1232  OsmC/Ohr family protein  56.43 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000831828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0336  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.636644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1197  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3415  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 154 aa  177  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00702998  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2420  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 140 aa  176  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.473875  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3763  OsmC-like protein  56.43 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.759493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2245  OsmC family protein  61.03 
 
 		 136 aa  176  9e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.362297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2607  OsmC/Ohr family protein  60 
 
 		 133 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0914  OsmC-like protein  58.99 
 
 		 139 aa  176  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0194  OsmC-like protein  56.43 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0197552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0677  OsmC family protein  56.43 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000026959  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0644  OsmC family protein  56.43 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000216559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3380  OsmC/Ohr family protein  57.14 
 
 		 154 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000435507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2706  OsmC family protein  55.71 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.935729 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0571  OsmC family protein  55.8 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000750944  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0597  OsmC family protein  55.8 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000609045  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2565  OsmC family protein  55.07 
 
 		 140 aa  173  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000000928304  normal  0.589052 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0489  hypothetical protein  62.79 
 
 		 148 aa  173  7e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00109519  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1231  OsmC family protein  57.97 
 
 		 139 aa  173  7e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000016936  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0365  OsmC family protein  62.02 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000167168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0380  OsmC family protein  62.02 
 
 		 148 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00128775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3551  OsmC family protein  61.15 
 
 		 140 aa  172  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0275  OsmC-like protein  56.62 
 
 		 138 aa  170  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000021415  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0930  OsmC family protein  58.96 
 
 		 149 aa  168  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.169385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1887  OsmC family protein  56.52 
 
 		 140 aa  167  6e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000280458  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0520  OsmC family protein  58.65 
 
 		 149 aa  163  9e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0744  OsmC-like protein  55.97 
 
 		 152 aa  160  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0645  OsmC family protein  55.64 
 
 		 152 aa  160  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.117468  normal  0.230797 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0680  OsmC family protein  55.22 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.444299  normal  0.178697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0659  OsmC family protein  55.22 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0732219  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0249  hypothetical protein  56.93 
 
 		 135 aa  155  3e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3944  hypothetical protein  56.93 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0732  OsmC-like protein  54.14 
 
 		 149 aa  153  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5684  OsmC family protein  54.48 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000158569  normal  0.43813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1086  OsmC family protein  53.85 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4579  hypothetical protein  54.81 
 
 		 135 aa  151  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0329282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0370  hypothetical protein  55.47 
 
 		 135 aa  150  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3852  hypothetical protein  54.07 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3701  hypothetical protein  56.2 
 
 		 135 aa  150  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3124  hypothetical protein  53.91 
 
 		 140 aa  150  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200026  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4031  hypothetical protein  53.33 
 
 		 135 aa  149  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.603572  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3783  hypothetical protein  52.17 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0730495  normal  0.0138382 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03207  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0203261  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0356  OsmC family protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0190113  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3731  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3662  hypothetical protein  51.45 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.511979  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3736  hypothetical protein  51.45 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4666  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00819258  normal  0.261614 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03159  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0178073  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3826  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.269487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0356  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3638  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000241703 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3770  hypothetical protein  51.45 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.356475  normal  0.48627 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3833  hypothetical protein  51.45 
 
 		 134 aa  146  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3553  hypothetical protein  52.9 
 
 		 134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3662  hypothetical protein  50.72 
 
 		 134 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.518022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0294  hypothetical protein  52.21 
 
 		 135 aa  143  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.618056  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0631  OsmC family protein  50 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1064  OsmC family protein  54.35 
 
 		 135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.156075  normal  0.0776132 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2006  hypothetical protein  52.21 
 
 		 137 aa  137  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2309  OsmC-like protein  52.21 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.87552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3415  OsmC family protein  54.26 
 
 		 140 aa  133  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000182997 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2738  OsmC-like protein  46.32 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1591  OsmC family protein  52.94 
 
 		 130 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277142  normal  0.616103 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2637  OsmC family protein  48.53 
 
 		 158 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01078  putative inner membrane protein  46.32 
 
 		 144 aa  129  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2326  OsmC family protein  55.2 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.556392 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0397  hypothetical protein  46.67 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.925526  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06689  hypothetical protein  45.59 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000792  OsmC/Ohr family protein  46.32 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>