54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3276 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3508  cyclase/dehydrase  88.36 
 
 		 150 aa  261  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  59.59 
 
 		 152 aa  181  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  53.1 
 
 		 144 aa  151  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  51.03 
 
 		 147 aa  144  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  50.68 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  47.95 
 
 		 145 aa  136  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2678  Polyketide cyclase/dehydrase  50 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.368637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  47.95 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  46.58 
 
 		 145 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  46.9 
 
 		 145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  46.21 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  43.15 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  44.52 
 
 		 145 aa  113  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  40.82 
 
 		 146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  41.78 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  43.84 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  43.84 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  40.41 
 
 		 144 aa  110  9e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  41.5 
 
 		 148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  40.14 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  38.36 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  31.29 
 
 		 146 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  31.03 
 
 		 146 aa  80.1  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  29.17 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  32.41 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  28.47 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  28.47 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  29.17 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  27.78 
 
 		 146 aa  67  0.00000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 147 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1641  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2307  cyclase/dehydrase  30.36 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.812492  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2219  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.16761  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2170  cyclase/dehydrase  27.68 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.950805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2698  cyclase/dehydrase  28.93 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0875708  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  27.56 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034604 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2811  cyclase/dehydrase  25.37 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0739801  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  27.08 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  26.06 
 
 		 148 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2812  cyclase/dehydrase  22.92 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0847205  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 		 146 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  23.38 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>