10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2884 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2884  acyltransferase 3  100 
 
 		 390 aa  759    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773243  normal  0.664883 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2916  acyltransferase 3  95.38 
 
 		 390 aa  731    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26930  glycosyl transferase  38.36 
 
 		 1099 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.938513 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3827  acyltransferase 3  39.89 
 
 		 401 aa  160  5e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3448  acyltransferase 3  40.56 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6199  hypothetical protein  31.73 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.307434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5081  beta-lactamase  47.92 
 
 		 784 aa  47  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.646809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4601  hypothetical protein  28.15 
 
 		 442 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  29.67 
 
 		 667 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  30.77 
 
 		 673 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.587252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>