17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0703 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0703  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.388175 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  81.7 
 
 		 167 aa  209  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  55.08 
 
 		 141 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  39.58 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  38.55 
 
 		 126 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  40.26 
 
 		 179 aa  48.5  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  40.85 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  39.19 
 
 		 140 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  38.75 
 
 		 106 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  32.28 
 
 		 136 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  37.21 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  41.94 
 
 		 148 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1362  hypothetical protein  49.06 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00460069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  43.08 
 
 		 99 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5054  Collagen triple helix repeat protein  27.14 
 
 		 298 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.86 
 
 		 573 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>