23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2146 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  47.25 
 
 
104 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  52.75 
 
 
191 aa  92.4  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  44.63 
 
 
148 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  41.38 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  52.11 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  45.88 
 
 
121 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  46.24 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  53.23 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  53.23 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  53.23 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  45.07 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  36.67 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  38.75 
 
 
185 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  39.74 
 
 
174 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  42.62 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09410  DivIVA protein  35.38 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0738055  normal  0.126085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  31.5 
 
 
136 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  30.83 
 
 
119 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>