20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1838 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  346  8e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  40.21 
 
 
185 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  42.31 
 
 
136 aa  65.5  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  47.22 
 
 
100 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  33.33 
 
 
174 aa  57  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  31.85 
 
 
167 aa  54.3  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  42.25 
 
 
125 aa  54.3  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1145  hypothetical protein  61.7 
 
 
93 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  47.27 
 
 
119 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0703  hypothetical protein  40.26 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.603681  normal  0.388175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  51.79 
 
 
206 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  45.61 
 
 
99 aa  45.8  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  51.79 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  36.54 
 
 
141 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3897  hypothetical protein  42.86 
 
 
267 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509881  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  34.41 
 
 
126 aa  44.7  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1176  hypothetical protein  39.68 
 
 
157 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8425  hypothetical protein  39.74 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  32.43 
 
 
104 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  24.47 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>