22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1145 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1145  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  176  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.223752  normal  0.0288746 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1838  hypothetical protein  53.09 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.450169  normal  0.227053 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  50 
 
 
100 aa  62  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  44.71 
 
 
185 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2799  hypothetical protein  58.14 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.374089  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  56.9 
 
 
140 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2519  hypothetical protein  42.57 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151548 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  41.94 
 
 
99 aa  52  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  55.17 
 
 
206 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  42.11 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  54.72 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  61.54 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  61.54 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  61.54 
 
 
103 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  41.18 
 
 
126 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  49.06 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15400  hypothetical protein  50 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.865228  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  50 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  39.53 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  56.41 
 
 
122 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  39.58 
 
 
106 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  35.35 
 
 
141 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>