20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0599 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0599  thioesterase-like protein  100 
 
 
138 aa  285  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0692  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  54.41 
 
 
136 aa  143  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0865  hypothetical protein  42.65 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0862335  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4082  hypothetical protein  43.26 
 
 
152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.959474  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2180  hypothetical protein  44.85 
 
 
147 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6350  putative enediyne biosynthesis protein  41.3 
 
 
165 aa  106  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0384361  hitchhiker  0.000308521 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2696  hypothetical protein  41.13 
 
 
154 aa  103  1e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.18359  normal  0.148918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6998  hypothetical protein  37.32 
 
 
142 aa  98.2  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.83128  hitchhiker  0.00920561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0552  hypothetical protein  40.29 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026302 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3928  hypothetical protein  32.35 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.893028 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4041  hypothetical protein  32.35 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3014  thioesterase superfamily protein  32.53 
 
 
604 aa  54.3  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0528433  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3507  hypothetical protein  27 
 
 
165 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00249299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2312  thioesterase superfamily protein  23.39 
 
 
142 aa  48.1  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7078  hypothetical protein  27.05 
 
 
157 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.758559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.2 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5607  hypothetical protein  25.22 
 
 
165 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.368142  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01911  thioesterase  23.64 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1541  hypothetical protein  23.64 
 
 
155 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  22.95 
 
 
146 aa  40.4  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>