10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0318 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0318  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  206  7e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0381  hypothetical protein  94.68 
 
 		 105 aa  169  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0467572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0842  hypothetical protein  42.42 
 
 		 100 aa  62.8  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02500  Protein of unknown function (DUF2516)  37.23 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0775  hypothetical protein  41.86 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4620  hypothetical protein  36 
 
 		 96 aa  48.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0845  cyclic nucleotide-binding  31.07 
 
 		 116 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.846806 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6772  hypothetical protein  34.41 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.25648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8229  hypothetical protein  34.62 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03620  Protein of unknown function (DUF2516)  31.03 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.693043  normal  0.415319 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>