15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3316 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
314 aa  613  9.999999999999999e-175  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000436445  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0640  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.32 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1660  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
320 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2152  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.41 
 
 
326 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37570  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  27.12 
 
 
312 aa  99.4  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295733  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0218  hypothetical protein  31.51 
 
 
314 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  27.16 
 
 
309 aa  89  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0595  integral membrane protein  23.49 
 
 
322 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.437392  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  28.26 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  24.53 
 
 
308 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0609  hypothetical protein  23.15 
 
 
322 aa  47  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  29.02 
 
 
315 aa  44.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  27.67 
 
 
300 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
317 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  24.06 
 
 
293 aa  42.7  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>