42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1766 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1766  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 
199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000016158  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3885  cell wall hydrolase/autolysin  61.22 
 
 
248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1278  cell wall hydrolase/autolysin  62.18 
 
 
247 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0878  cell wall hydrolase/autolysin  30.61 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2816  cell wall hydrolase/autolysin  32.18 
 
 
213 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.812888  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1651  cell wall hydrolase/autolysin  32.54 
 
 
1504 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  25.13 
 
 
236 aa  59.3  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  25.35 
 
 
240 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2277  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.110175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  33.33 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2446  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2195  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.2045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2237  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
245 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0334199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1228  cell wall hydrolase/autolysin  26.63 
 
 
438 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000450762  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0926  cell wall hydrolase/autolysin  27.68 
 
 
219 aa  48.9  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2834  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34 
 
 
244 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2870  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34 
 
 
244 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00570311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2849  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34 
 
 
244 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000907792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2461  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.66 
 
 
244 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1724  cell wall hydrolase/autolysin  32.69 
 
 
257 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0475505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2294  cell wall hydrolase/autolysin  27.7 
 
 
358 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1804  cell wall hydrolase/autolysin  25.11 
 
 
240 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.052646  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2112  cell wall hydrolase/autolysin  26.13 
 
 
373 aa  46.2  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0823125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.63 
 
 
261 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0529665  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  26.73 
 
 
364 aa  45.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1162  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.06 
 
 
233 aa  45.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.820741  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  25.23 
 
 
413 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0616  cell wall hydrolase/autolysin  28.22 
 
 
361 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.71 
 
 
249 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.48 
 
 
190 aa  43.9  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  26.92 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39690  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  24.18 
 
 
382 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3124  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.7 
 
 
471 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0129818  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  26.55 
 
 
378 aa  43.1  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  27.88 
 
 
361 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0368  cell wall hydrolase/autolysin  26.23 
 
 
474 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000387898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0339  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.81 
 
 
706 aa  42.4  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1722  cell wall hydrolase/autolysin  27.17 
 
 
291 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00111175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7088  cell wall hydrolase/autolysin  29 
 
 
379 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06721  cell wall hydrolase/autolysin  26.96 
 
 
361 aa  41.6  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.347132  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1689  cell wall hydrolase/autolysin  27.17 
 
 
291 aa  42  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.147048  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3619  cell wall hydrolase/autolysin  33.94 
 
 
313 aa  41.6  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.802629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>