43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0908 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  100 
 
 
507 aa  1001    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  42.27 
 
 
497 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  40 
 
 
508 aa  357  3.9999999999999996e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  35.7 
 
 
620 aa  300  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  38.16 
 
 
481 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  35.21 
 
 
545 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  42.8 
 
 
253 aa  204  3e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  27.11 
 
 
495 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  30.82 
 
 
503 aa  188  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  28.48 
 
 
506 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  41.15 
 
 
230 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  42.04 
 
 
243 aa  182  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  42.04 
 
 
245 aa  182  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  45.85 
 
 
230 aa  179  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  30.86 
 
 
503 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  38.53 
 
 
246 aa  153  8.999999999999999e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  25.78 
 
 
601 aa  145  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  35.22 
 
 
231 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  36.36 
 
 
288 aa  137  4e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  31.88 
 
 
232 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  33.02 
 
 
242 aa  125  3e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  29.57 
 
 
278 aa  120  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  31.54 
 
 
245 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  30.61 
 
 
269 aa  111  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  30.54 
 
 
244 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  32.02 
 
 
244 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  30.51 
 
 
244 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  28.45 
 
 
262 aa  106  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  29.24 
 
 
244 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  27.62 
 
 
255 aa  104  4e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  27.35 
 
 
261 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  31.31 
 
 
245 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  30.08 
 
 
244 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  27 
 
 
263 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  27.39 
 
 
261 aa  100  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  35.48 
 
 
244 aa  100  9e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  27.42 
 
 
261 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  30.43 
 
 
248 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  28.37 
 
 
497 aa  97.8  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  24.11 
 
 
646 aa  94.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  29.13 
 
 
245 aa  83.6  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  26.32 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  27.52 
 
 
255 aa  69.7  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.611874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>