13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_R0012 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_R0012  tRNA-OTHER  100 
 
 		 114 bp  226  9e-58  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  MSED_0  tRNA-OTHER  86.21 
 
 		 112 bp  89.7  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.674515  normal  0.0251104 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_R0003  tRNA-OTHER  96.43 
 
 		 103 bp  48.1  0.0005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0822351  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0043  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  48.1  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0039  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0047  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.596916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0016  tRNA-Thr  96.3 
 
 		 76 bp  46.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0033  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  46.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.374525 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0043  tRNA-OTHER  96.15 
 
 		 98 bp  44.1  0.007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0004  tRNA-Ser  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 92 bp  44.1  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0470905  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0042  tRNA-Met  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.231974 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0009  tRNA-Ser  100 
 
 		 89 bp  44.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496471  hitchhiker  0.00256028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>