25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2840 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2840  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 103 aa  207  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  44.21 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0188  ArsR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 86 aa  67.4  0.00000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.54087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 		 120 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0470  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0242594 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0060  regulatory protein, ArsR  28.57 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.384966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3137  hypothetical protein  33.33 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.581839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1599  ArsR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.556289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1028  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 330 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  25.51 
 
 		 303 aa  45.4  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7857  hypothetical protein  27.38 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.739073  normal  0.172696 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  30.34 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1598  putative PAS/PAC sensor protein  26.44 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0419  transcriptional regulator, ArsR family  29.9 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2689  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.515825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0889  putative transcriptional regulator  27.63 
 
 		 95 aa  44.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343594  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0936  regulator of arsenical resistance  37.14 
 
 		 113 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0727  transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 119 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4062  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4430  hypothetical protein  25 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4544  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.234964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1426  hypothetical protein  25.29 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  24.49 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>