23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0953 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0953  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1682  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.08 
 
 		 117 aa  51.6  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0952  hypothetical protein  31.82 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.411513 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1352  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.182081  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2000  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 94 aa  47.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2811  transcriptional regulator  34.48 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2840  transcriptional regulator, ArsR family  35.11 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1184  transcriptional regulator, ArsR family  30.95 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4026  hypothetical protein  31.58 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.252958 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3477  MarR/EmrR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36190  hypothetical protein  32.97 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0328  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.018451 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1252  putative PAS/PAC sensor protein  27.91 
 
 		 303 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1630  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.917024  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1300  transcriptional regulator  33 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.223469  normal  0.471432 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3450  hypothetical protein  32.1 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0548  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 97 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0542842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0230  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 		 325 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0562  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 		 332 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1165  hypothetical protein  31.17 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.758935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1413  transcriptional regulator  29.87 
 
 		 112 aa  40  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.946834  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0184  regulatory protein, ArsR  33.33 
 
 		 107 aa  40  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.678955  normal  0.871584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>