17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1006 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1006  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
343 aa  689    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0540  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 
326 aa  307  2.0000000000000002e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.711778 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1612  FAD dependent oxidoreductase  30.77 
 
 
342 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0497  FAD dependent oxidoreductase  30.06 
 
 
351 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.317622  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0637  FAD dependent oxidoreductase  28.48 
 
 
342 aa  108  2e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0669  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 
348 aa  107  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0537  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
339 aa  99.4  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2625  FAD dependent oxidoreductase  24.48 
 
 
393 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0620146  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  26.34 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.35 
 
 
373 aa  49.7  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
430 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3020  FAD dependent oxidoreductase  26.58 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.393882  normal  0.050284 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5888  oxidoreductase  28.7 
 
 
445 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 
390 aa  44.3  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
430 aa  43.1  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  32.18 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1292  FAD dependent oxidoreductase  25.15 
 
 
395 aa  42.7  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>