43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1826 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1826  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.299788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2762  hypothetical protein  90.95 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0875471  normal  0.055304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1591  hypothetical protein  90.16 
 
 		 244 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2271  hypothetical protein  86.89 
 
 		 245 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00372269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1497  hypothetical protein  86.48 
 
 		 244 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1220  hypothetical protein  72.61 
 
 		 244 aa  353  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.210254 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1953  hypothetical protein  69.04 
 
 		 245 aa  323  1e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0164  membrane protein  74.9 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.634614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3684  hypothetical protein  65.07 
 
 		 248 aa  273  1.0000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3466  hypothetical protein  50.21 
 
 		 495 aa  238  8e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1088  protein of unknown function DUF1538  49.37 
 
 		 506 aa  224  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1592  hypothetical protein  46.12 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2272  hypothetical protein  46.03 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000140028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1827  hypothetical protein  47.74 
 
 		 261 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.149521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1498  hypothetical protein  45.53 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.660987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2761  hypothetical protein  46.91 
 
 		 263 aa  201  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.0518932 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0165  membrane protein  43.8 
 
 		 261 aa  200  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0802  protein of unknown function DUF1538  46.28 
 
 		 503 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0659  hypothetical protein  47.64 
 
 		 503 aa  198  7.999999999999999e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201808 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3479  hypothetical protein  42.19 
 
 		 245 aa  192  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.405509 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1952  hypothetical protein  41.25 
 
 		 278 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3685  hypothetical protein  43.58 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1221  ABC transporter for copper permease protein  43.41 
 
 		 264 aa  185  7e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.121957 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0800  protein of unknown function DUF1538  40.16 
 
 		 497 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0745  hypothetical protein  35.04 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.189103  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3139  membrane spanning protein  37.4 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3478  hypothetical protein  34.6 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611874 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0341  protein of unknown function DUF1538  34.03 
 
 		 230 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766414 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0342  protein of unknown function DUF1538  33.19 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510639 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0101  hypothetical protein  36 
 
 		 601 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0474  hypothetical protein  34.62 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0475  hypothetical protein  32.9 
 
 		 230 aa  122  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322383  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0746  hypothetical protein  30.74 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0127316  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0337  hypothetical protein  32.61 
 
 		 232 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0876004  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0908  protein of unknown function DUF1538  30.08 
 
 		 507 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0017  hypothetical protein  32.34 
 
 		 620 aa  104  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000261883  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2378  hypothetical protein  32.13 
 
 		 646 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2615  hypothetical protein  32.46 
 
 		 508 aa  96.3  4e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0107308  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1143  protein of unknown function DUF1538  29.79 
 
 		 497 aa  94.4  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150487  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1723  protein of unknown function DUF1538  30.53 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1786  protein of unknown function DUF1538  28.81 
 
 		 545 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0836999  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0323  hypothetical protein  31.98 
 
 		 481 aa  77.4  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0750362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>