43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1167 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1167  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1262  hypothetical protein  70.27 
 
 		 111 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000230441 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2748  hypothetical protein  43.64 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.344464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1365  hypothetical protein  55.86 
 
 		 111 aa  108  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3009  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2830  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  104  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.616543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2914  hypothetical protein  48.51 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2912  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  104  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1262  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1295  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1218  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3095  hypothetical protein  53.15 
 
 		 111 aa  102  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.038994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1176  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1057  hypothetical protein  45.28 
 
 		 112 aa  97.4  6e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.455459  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1071  hypothetical protein  54.05 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0897  hypothetical protein  39.39 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.787189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  36.73 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  28.45 
 
 		 118 aa  50.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  30.53 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  33.94 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  30.53 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  29.47 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  29.47 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  29.47 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  33.03 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  30.21 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  30.61 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  26.88 
 
 		 122 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0839  hypothetical protein  32.47 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  32.32 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  32.32 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  28.42 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  27.37 
 
 		 131 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  27.71 
 
 		 134 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>