12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8007 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8007  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  288  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2791  hypothetical protein  66.2 
 
 		 145 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.688451  normal  0.192686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3445  hypothetical protein  46.56 
 
 		 141 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.815991  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0641  hypothetical protein  40.28 
 
 		 156 aa  98.2  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0202  hypothetical protein  40.31 
 
 		 155 aa  91.3  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4042  hypothetical protein  41.76 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.119824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1486  hypothetical protein  44.44 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0685167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8040  hypothetical protein  31.79 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1129  hypothetical protein  31.03 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.284391 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3290  hypothetical protein  30.23 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.165615  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1365  secreted protein  35.34 
 
 		 171 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866634  normal  0.409644 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2109  hypothetical protein  30.63 
 
 		 204 aa  40.8  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.331867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>