26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7108 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  174  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  75 
 
 
83 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  71.21 
 
 
80 aa  111  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  60.71 
 
 
92 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  66.67 
 
 
78 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  64.29 
 
 
84 aa  105  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  64.94 
 
 
80 aa  104  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  53.95 
 
 
78 aa  102  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  58.54 
 
 
210 aa  98.2  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  62.16 
 
 
79 aa  97.4  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  51.32 
 
 
92 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  57.78 
 
 
89 aa  94.7  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  63.77 
 
 
86 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  58.11 
 
 
78 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  48.68 
 
 
77 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  56.79 
 
 
85 aa  90.9  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  52.81 
 
 
93 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  65.33 
 
 
79 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  47.56 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  47.56 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  47.56 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  64.47 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  64.47 
 
 
79 aa  81.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  45.12 
 
 
84 aa  80.5  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  45.12 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  47.83 
 
 
93 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>