26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4367 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  63.29 
 
 		 79 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  62.5 
 
 		 84 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  47.56 
 
 		 92 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  48.35 
 
 		 92 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  51.25 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  48.15 
 
 		 77 aa  87  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  52.81 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  46.34 
 
 		 78 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  52.5 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  59.74 
 
 		 80 aa  85.1  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  56.16 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  53.85 
 
 		 78 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  50.7 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  48.75 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  59.74 
 
 		 79 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  59.74 
 
 		 79 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  59.74 
 
 		 79 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  42.86 
 
 		 93 aa  76.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  48.57 
 
 		 89 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  47.89 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  47.14 
 
 		 80 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>