26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2408 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  75 
 
 
86 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  67.95 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  72.06 
 
 
84 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  68 
 
 
92 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  64.86 
 
 
78 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  55.84 
 
 
78 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  60.53 
 
 
80 aa  98.6  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  59.52 
 
 
89 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  56.58 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  54.76 
 
 
210 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  58.33 
 
 
86 aa  94.4  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  58.9 
 
 
79 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  57.14 
 
 
85 aa  90.1  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  46.75 
 
 
77 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  51.35 
 
 
78 aa  83.6  8e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  48.75 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  62.5 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  62.5 
 
 
79 aa  78.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  62.5 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  47.62 
 
 
84 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  50.6 
 
 
84 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  50.6 
 
 
84 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  50.6 
 
 
84 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  46.34 
 
 
93 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  46.75 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>