26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1482 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  90.7 
 
 
86 aa  166  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  71.26 
 
 
210 aa  144  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  69.41 
 
 
85 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  67.47 
 
 
84 aa  120  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  60 
 
 
92 aa  104  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  58.97 
 
 
78 aa  98.2  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  59.52 
 
 
83 aa  97.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  59.49 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  56.96 
 
 
92 aa  96.7  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  57.78 
 
 
86 aa  94.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  57.69 
 
 
80 aa  90.5  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  59.74 
 
 
78 aa  88.6  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  51.9 
 
 
77 aa  84  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  56.58 
 
 
79 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  56.92 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  49.32 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  48.57 
 
 
93 aa  73.6  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  51.47 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  49.28 
 
 
93 aa  70.9  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  55 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  55 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  55.93 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>