26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2443 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_2443  hypothetical protein  100 
 
 
85 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0875175  normal  0.12907 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1907  hypothetical protein  68.24 
 
 
210 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.978893  normal  0.652925 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1482  hypothetical protein  69.41 
 
 
89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.131633  hitchhiker  0.000153902 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1540  hypothetical protein  67.06 
 
 
86 aa  126  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216845  normal  0.263895 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37320  hypothetical protein  65.85 
 
 
84 aa  117  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.346472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2282  hypothetical protein  55.95 
 
 
92 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4068  hypothetical protein  65.33 
 
 
78 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20456  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1414  hypothetical protein  60.26 
 
 
77 aa  95.9  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000150753  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1004  hypothetical protein  58.67 
 
 
79 aa  94.4  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146583  decreased coverage  0.00213317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2416  hypothetical protein  53.95 
 
 
80 aa  91.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000121553  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3358  hypothetical protein  51.95 
 
 
78 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.044934  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7108  hypothetical protein  56.79 
 
 
86 aa  90.9  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0862817  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2408  hypothetical protein  57.14 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.140352  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5792  hypothetical protein  57.35 
 
 
84 aa  89  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2667  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00681101  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0476  hypothetical protein  57.69 
 
 
80 aa  88.2  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176401  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1868  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0840588 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1888  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0219416  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1934  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.809347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1038  hypothetical protein  55.88 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4367  hypothetical protein  56.16 
 
 
93 aa  84.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1820  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0959  hypothetical protein  62.07 
 
 
79 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.818056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1017  hypothetical protein  62.07 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00426574  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1020  hypothetical protein  62.07 
 
 
79 aa  78.2  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.442374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2830  hypothetical protein  42.86 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0398906  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>