20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7107 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7107  hypothetical protein  100 
 
 		 829 aa  1367    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  28.45 
 
 		 1034 aa  89.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2355  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  32.18 
 
 		 345 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37425  predicted protein  41.89 
 
 		 1569 aa  54.7  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.61446  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2382  TRD5  28.38 
 
 		 253 aa  53.9  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4626  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  28.12 
 
 		 602 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8811  hypothetical protein  32.4 
 
 		 389 aa  49.3  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2266  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  21.36 
 
 		 347 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1353  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  24.7 
 
 		 351 aa  47  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4072  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  22.29 
 
 		 351 aa  47  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.125317 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2721  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  22.4 
 
 		 352 aa  46.2  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4176  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  45.4  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1493  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  29.1 
 
 		 353 aa  45.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  22.58 
 
 		 191 aa  45.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17180  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  29.1 
 
 		 353 aa  45.4  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2538  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  20.63 
 
 		 341 aa  45.1  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.215144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1601  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  28.57 
 
 		 351 aa  45.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1111  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  25 
 
 		 351 aa  44.7  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3043  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] glucosamine N-acyltransferase  26.92 
 
 		 351 aa  44.3  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4502  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  20.57 
 
 		 322 aa  44.3  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>