35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5975 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5975  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  268  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.073965 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1547  hypothetical protein  43.09 
 
 
143 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.296698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2954  hypothetical protein  36.29 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2225  hypothetical protein  32.79 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7525  hypothetical protein  38.93 
 
 
130 aa  62  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.321809  normal  0.789852 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4449  hypothetical protein  33.04 
 
 
129 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.904253  normal  0.0764315 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0063  hypothetical protein  31.9 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3498  hypothetical protein  30.7 
 
 
138 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.718505 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0991  hypothetical protein  26.36 
 
 
133 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00914554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4455  hypothetical protein  24.81 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00728283  normal  0.540789 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0206  hypothetical protein  35.54 
 
 
131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0880  hypothetical protein  24.03 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0273  hypothetical protein  29.46 
 
 
139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.739409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0737  hypothetical protein  24.81 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00542043  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0917  hypothetical protein  25.58 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000348146  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0051  hypothetical protein  29.46 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3291  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.932341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1836  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2716  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374987  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0058  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.118011  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0059  hypothetical protein  28.57 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0281  hypothetical protein  25.47 
 
 
130 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.106123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3364  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 
137 aa  47  0.00009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5869  protein of unknown function DUF1486  27.2 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0723  hypothetical protein  24.81 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000344598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0736  hypothetical protein  24.81 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000116792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4379  hypothetical protein  25.77 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  4.73238e-23 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0922  hypothetical protein  23.77 
 
 
133 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56602e-43 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0272  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  32.03 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5481  hypothetical protein  23.48 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0827  hypothetical protein  24.03 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000717124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0787  hypothetical protein  24.03 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185492  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41030  hypothetical protein  30.36 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35800  hypothetical protein  27.64 
 
 
287 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0181  putative limonene-1,2-epoxide hydrolase  31.25 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>