20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3012 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3012  hypothetical protein  100 
 
 		 225 aa  450  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218964  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1501  hypothetical protein  55.25 
 
 		 218 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.268016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3158  protein of unknown function DUF1396  41.07 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0785355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05600  Protein of unknown function (DUF1396)  37 
 
 		 227 aa  149  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0367  protein of unknown function DUF1396  30 
 
 		 243 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0720585  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07420  Protein of unknown function (DUF1396)  30.73 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2435  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2429  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2388  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11440  lipoprotein lprG  28.63 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2692  hypothetical protein  31.2 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3724  hypothetical protein  29.58 
 
 		 256 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.464442  normal  0.0746496 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3312  protein of unknown function DUF1396  30.96 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2324  protein of unknown function DUF1396  25.11 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11399  lipoprotein lprF  23.9 
 
 		 261 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1964  protein of unknown function DUF1396  26.71 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2927  hypothetical protein  28.45 
 
 		 240 aa  49.3  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1177  hypothetical protein  25.54 
 
 		 252 aa  46.6  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.267481  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1961  hypothetical protein  25.96 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.55535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11296  lipoprotein lprA  25.63 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>