17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3046 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3731  hypothetical protein  61.76 
 
 
515 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3075  hypothetical protein  62.6 
 
 
515 aa  661    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0733836  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0897  hypothetical protein  62.02 
 
 
515 aa  661    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0860  hypothetical protein  63.15 
 
 
515 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.258003  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3411  hypothetical protein  62.86 
 
 
518 aa  678    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3046  peptidase S41  100 
 
 
521 aa  1068    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.854306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0951  hypothetical protein  62.81 
 
 
520 aa  676    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0925  hypothetical protein  63.2 
 
 
520 aa  681    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0959  hypothetical protein  63.2 
 
 
520 aa  681    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.628982  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2894  hypothetical protein  34.61 
 
 
547 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198143  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0785  peptidase S41  33.2 
 
 
485 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105826  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3798  hypothetical protein  34.12 
 
 
514 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661143  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0670  hypothetical protein  32.3 
 
 
488 aa  256  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000436312 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0660  hypothetical protein  27.94 
 
 
498 aa  177  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  27.62 
 
 
710 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  33.7 
 
 
444 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  28.26 
 
 
457 aa  43.9  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>