15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0670 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0670  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  991    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000436312 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3798  hypothetical protein  33.74 
 
 		 514 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0925  hypothetical protein  33.79 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0959  hypothetical protein  33.79 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.628982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3046  peptidase S41  31.98 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.854306  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0785  peptidase S41  31.34 
 
 		 485 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0951  hypothetical protein  33.01 
 
 		 520 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0860  hypothetical protein  31.57 
 
 		 515 aa  241  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.258003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3075  hypothetical protein  31.38 
 
 		 515 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0733836  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0897  hypothetical protein  30.11 
 
 		 515 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3731  hypothetical protein  29.43 
 
 		 515 aa  233  5e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2894  hypothetical protein  31.49 
 
 		 547 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.198143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0660  hypothetical protein  29.17 
 
 		 498 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  31.25 
 
 		 747 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>