26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0958 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0958  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  254  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0557977  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2812  hypothetical protein  97.56 
 
 		 124 aa  246  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  61.34 
 
 		 119 aa  153  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  55.83 
 
 		 123 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  54.17 
 
 		 123 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3649  hypothetical protein  45.38 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  44.26 
 
 		 123 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  37.5 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  30 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  35.83 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  37.19 
 
 		 121 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  36.52 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  35.34 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  32.5 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  28.7 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  30 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  32 
 
 		 129 aa  54.3  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2447  putative RNase H  33.33 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121637  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  27.27 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  35.45 
 
 		 319 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  31.25 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  31.86 
 
 		 358 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  28.18 
 
 		 291 aa  47  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  30.21 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  29.06 
 
 		 336 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  26.32 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>