15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0843 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0843  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  271  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00211691  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0748  hypothetical protein  84.5 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.314999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3570  hypothetical protein  84.5 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.217533  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3691  hypothetical protein  84.5 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0332072  normal  0.0136515 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3502  hypothetical protein  84.5 
 
 		 127 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3979  hypothetical protein  73.91 
 
 		 129 aa  191  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76505 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3063  hypothetical protein  66.67 
 
 		 139 aa  189  9e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0556  hypothetical protein  70.49 
 
 		 142 aa  186  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0289  hypothetical protein  33.83 
 
 		 136 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.137948  hitchhiker  0.0000108135 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1424  hypothetical protein  31.15 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259146  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0682  hypothetical protein  29.37 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0897  hypothetical protein  26.77 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0111601  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3183  hypothetical protein  25 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0657806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0879  hypothetical protein  25.74 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133146  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0982  hypothetical protein  28.23 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0757327  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>