31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4037 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4037  hypothetical protein  100 
 
 
82 aa  167  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0386053 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1574  hypothetical protein  65.85 
 
 
82 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3327  hypothetical protein  68.29 
 
 
82 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.86974  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2916  hypothetical protein  67.07 
 
 
82 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.480647  normal  0.0883091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2917  hypothetical protein  63.64 
 
 
84 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.862357  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3433  hypothetical protein  63.51 
 
 
77 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14303  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2919  hypothetical protein  58.44 
 
 
179 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3249  hypothetical protein  64.06 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2375  hypothetical protein  61.11 
 
 
73 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0792048  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1777  hypothetical protein  54.76 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.256897  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0811  hypothetical protein  58.82 
 
 
77 aa  87  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009472  Acry_3623  hypothetical protein  50.59 
 
 
96 aa  77  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1139  hypothetical protein  52.86 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0127  hypothetical protein  53.62 
 
 
90 aa  73.9  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00495666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4103  hypothetical protein  47.3 
 
 
78 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.918286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2869  hypothetical protein  47.76 
 
 
104 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2432  hypothetical protein  48.53 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2980  hypothetical protein  46.97 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2643  hypothetical protein  41.03 
 
 
79 aa  61.6  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1434  hypothetical protein  50 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1231  hypothetical protein  49.23 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1907  hypothetical protein  46.27 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0497994 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4275  hypothetical protein  40 
 
 
79 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532653  normal  0.601848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2603  hypothetical protein  38.03 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355164  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1935  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  53.9  0.0000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.795864  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0949  hypothetical protein  38.36 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000036055  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1209  hypothetical protein  38.81 
 
 
86 aa  51.2  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4993  hypothetical protein  35.38 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.819538  normal  0.0403555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2822  hypothetical protein  47.06 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821757  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4439  hypothetical protein  39.66 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1958  hypothetical protein  28.05 
 
 
80 aa  40.4  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000377235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>