27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2447 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2447  putative RNase H  100 
 
 		 122 aa  256  9e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.121637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4440  hypothetical protein  45 
 
 		 151 aa  96.7  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.251753  normal  0.785852 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0896  Ribonuclease H  38.98 
 
 		 358 aa  78.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.317285 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0781  ribonuclease H  38.98 
 
 		 319 aa  72  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0142  hypothetical protein  37.5 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3601  hypothetical protein  38.46 
 
 		 121 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3649  hypothetical protein  34.75 
 
 		 120 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0162  hypothetical protein  36.21 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0323  putative RNase H  36.28 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00762994  normal  0.0205227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1152  hypothetical protein  35.71 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59590  hypothetical protein  35 
 
 		 119 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000132336  hitchhiker  4.1623000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0126  hypothetical protein  33.61 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4145  hypothetical protein  32.76 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07860  RNase HI  33.61 
 
 		 336 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0989  hypothetical protein  31.62 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.022347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0443  hypothetical protein  35.24 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02448  hypothetical protein  31.03 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09420  RNase HI  30.43 
 
 		 291 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.226214 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3183  hypothetical protein  32.17 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0958  hypothetical protein  33.33 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0557977  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2113  hypothetical protein  29.17 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2812  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0790  hypothetical protein  29.75 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606872  normal  0.0284601 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0934  hypothetical protein  32.99 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01310  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  29.66 
 
 		 338 aa  44.3  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1301  hypothetical protein  28.81 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.540321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>